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Western Blot
Definición de Western Blot
Western blot, también conocido como inmunotransferencia, es el proceso de separar proteínas e identificarlas en una muestra biológica compleja.
- El uso de electroforesis en gel de poliacrilamida es un requisito previo para el Western Blot con el fin de separar las proteínas antes de su identificación.
- El proceso de transferencia Western implica la transferencia de proteínas separadas por SDS PAGE a una membrana absorbente. A continuación, las proteínas se pueden identificar en la membrana por diferentes medios.
- El Western Blot ha revolucionado el campo de la inmunología con el uso de sondas de anticuerpos contra proteínas unidas a la membrana.
- La inmunodetección de proteínas tiene una amplia aplicación en bioquímica y otras ciencias, ya que puede detectar y caracterizar multitud de proteínas.
- La sensibilidad del proceso depende de la eficiencia de la retención de transferencia de proteínas durante el procesamiento y la detección final.
- La transferencia Western o transferencia de proteínas depende de la especificidad de la interacción entre la proteína de interés y la sonda utilizada para la detección de la proteína.
- A diferencia de la transferencia Southern que utiliza sondas de ácido nucleico marcadas radiactivamente, la transferencia Western generalmente usa un segundo anticuerpo etiquetado con una enzima.
- La transferencia Western tiene una serie de ventajas sobre otras técnicas similares, ya que el proceso solo requiere el uso de una pequeña cantidad de reactivos y la misma transferencia de proteínas se puede usar para múltiples análisis.
Principio de Western Blot
- El principio del western blot es la interacción entre las proteínas y las sondas utilizadas para la detección de las proteínas.
- Las proteínas utilizadas para el western blot se separan mediante electroforesis en gel para obtenerlas en una matriz de gel.
- Luego, las proteínas se transfieren a una membrana de nitrocelulosa o fluoruro de polivinilideno (PVDF), donde se inmovilizan. La transferencia de la proteína se conoce como transferencia.
- La proteína de la membrana puede detectarse mediante el uso de un anticuerpo primario marcado con informador dirigido contra la proteína o un anticuerpo secundario marcado con informador dirigido al anticuerpo primario.
- El indicador o sonda presente en el anticuerpo puede ser una enzima que produce una reacción de color o una señal luminiscente en el sitio de unión antígeno-anticuerpo que produce una señal fluorescente en presencia de un sustrato particular.
- La señal o color generado por la sonda requiere un sistema de detección que sea apropiado para la señal o intensidad generada.
Requisitos para Western Blot
Electroforesis en gel
- Gel (NuPAGE)
- Fuente de alimentación básica
- Tampón de muestra
- Bloque calefactor
- Tampón reductor de muestras
- Escalera de proteínas teñida previamente
Transferencia de Proteínas
- Mini Trans-Blot que consta de tanque, tapa y módulo blot. El conjunto se almacena con hielo refrigerante para que se congele cuando sea necesario.
- Papel de filtro de nitrocelulosa de 0,45 µm
- Tampón de transferencia NuPAGE
- Metanol
- Plato Pyrex cuadrado
- Placa de Petri de plástico desechable cuadrada
- Navaja de afeitar y cuchillo de gel
- Fuente de alimentación básica
Western Blot
- Solución salina tamponada con Tris 10x con Tween 20 al 1%.
- Criba vibradora
- Leche en polvo descremada al 10%
- Placa de Petri de plástico desechable cuadrada
- Bolsas de plastico
- Sellador térmico de impulsos
- Anticuerpo primario
- Anticuerpo secundario conjugado con peroxidasa de rábano picante contra la especie huésped del anticuerpo primario.
- Sustrato quimioluminiscente
- Sistema de documentación en gel
Procedimiento de Western Blot
El proceso de Western Blot consta de los siguientes pasos;
1. Preparación de la muestra
- Las muestras más comúnmente utilizadas para Western Blot son los lisados celulares que se recogen mediante el proceso de extracción.
- La extracción se puede lograr por diferentes medios como destrucción mecánica, extracción química o el uso de enzimas.
- La extracción de a menudo se realiza a temperatura fría en presencia de inhibidores de proteasa para evitar la desnaturalización de las proteínas.
2. Electroforesis en gel
- La muestra de proteína se diluye con el tampón de muestra y se calienta y agita durante 10 minutos a 70 ° C.
- A continuación, la muestra se centrifuga a 5000 g.
- La caja de gel se saca de la bolsa y se coloca en el tanque de compensación contra el sello de goma con las paredes de gel mirando hacia el interior del depósito del tanque.
- El tampón en funcionamiento se vierte en el depósito superior mientras se asegura que no se produzcan fugas en el depósito inferior.
- Luego, cada uno de los pocillos se carga con un volumen igual de muestra desnaturalizada por calor, y uno de los carriles se reserva para la escalera de proteínas.
- La tapa se coloca en el tanque y se conecta a la fuente de alimentación.
- Se deja que la corrida funcione a 200 V constante durante 50 minutos.
3. Transferencia de proteínas
- El tampón de transferencia se prepara añadiendo metanol al 10% al tampón.
- La caja de transferencia se toma y se coloca. Luego se cubre con un búfer de transferencia.
- Se toma una esponja de espuma y se coloca en la parte posterior, sobre la cual se coloca el papel de filtro. Estos deben colocarse para asegurarse de que ambos estén mojados y ligeramente sumergidos.
- El gel se saca del tanque y se coloca sobre el papel de filtro húmedo.
- La membrana de nitrocelulosa se humedece con el tampón de transferencia y se coloca encima del gel de manera que no haya burbujas entre el gel y la membrana.
- La caja de transferencia se coloca en el tanque de transferencia, que se llena más con tampón de transferencia.
- Luego, el tanque se conecta a la alimentación a 100 V durante 1 hora.
- Una vez que se completa la transferencia, se retira la caja de transferencia y la membrana de nitrocelulosa se retira del gel.
4. Inmunodetección
- La membrana se lava con solución salina tamponada con Tris durante 5 minutos en una placa de Petri.
- La leche en polvo descremada al 10% se mezcla con el tampón Tris y la membrana se cubre con la mezcla durante 30 minutos a temperatura ambiente.
- La membrana se lava con el tampón Tris para eliminar cualquier exceso de mezcla que quede en la membrana.
- Con la ayuda de las pinzas, la membrana se transfiere a una nueva placa de Petri en la que se agrega el anticuerpo primario.
- La membrana con el anticuerpo se incuba durante 3 horas a temperatura ambiente. Posteriormente, la membrana se lava después de la incubación con el tampón Tris.
- La membrana se transfiere nuevamente a una nueva placa de Petri, donde se agrega un anticuerpo secundario conjugado con HRP. La membrana se incuba durante 1 hora. La concentración de anticuerpos secundarios a menudo permanece en 1 µg / ml, pero esto también depende de la dilución.
- La membrana se lava nuevamente con tampón Tris para eliminar el exceso de anticuerpos de la superficie.
- Se incuba la membrana con el sustrato durante 5 minutos y se realiza la observación.
Interpretación de resultados de Western Blot
- El resultado de la transferencia Western depende del tipo de sondas utilizadas durante el proceso.
- Si se usa un anticuerpo secundario conjugado con enzima, la reacción entre el sustrato y la enzima produce un color.
- El tinte soluble se convierte en una forma insoluble, lo que da como resultado un color diferente en la membrana.
- Para detener el desarrollo de una mancha, el tinte se elimina lavando la membrana.
- A continuación, los niveles de proteínas pueden evaluarse mediante espectrofotometría.
Aplicaciones de Western Blot
- El Western Blot es un método excelente con una alta sensibilidad para detectar una proteína en particular, incluso en poca cantidad.
- El Western Blot se ha utilizado en el diagnóstico clínico de diferentes enfermedades. La prueba de confirmación del VIH implica una transferencia de Western mediante la detección de anticuerpos anti-VIH en el suero.
- La técnica se ha utilizado para cuantificar proteínas y otros productos génicos en estudios de expresión génica.
- Dado que la transferencia de Western detecta las proteínas por su tamaño y capacidad para unirse al anticuerpo, es apropiado para evaluar las expresiones de proteínas en las células y analizar más las fracciones de proteínas durante la purificación de proteínas.
- La transferencia Western también se utiliza para el análisis de diferentes biomarcadores como factores de crecimiento, citocinas y hormonas.
Limitaciones de Western Blot
- Dado que es un proceso muy sensible, cualquier desequilibrio en el proceso puede afectar los resultados de todo el proceso.
- En algunos casos, no se pueden observar bandas o bandas erróneas debido a la transferencia insuficiente de las proteínas.
- La prueba solo se puede utilizar como prueba semicuantitativa, ya que la estimación no siempre es precisa.
- El proceso requiere mucho tiempo y es complejo, por lo que solo puede ser realizado por personal bien capacitado.
- La transferencia de Western solo se puede realizar para proteínas si los anticuerpos primarios para las proteínas están disponibles.
- Algunos anticuerpos pueden exhibir efectos fuera del objetivo al interactuar con más de una proteína en la muestra.
- La técnica es un proceso costoso con el costo de los anticuerpos y los métodos de detección costosos.
- Es posible que la membrana no retenga las proteínas pequeñas, mientras que las proteínas más grandes son difíciles de transferir a la membrana.